Традиции ТУСУРа отмечать талантливых школьников ректорской стипендией исполнилось четыре года. Она была учреждена в 2018 году в рамках сотрудничества с Томским физико-техническим лицеем (ТФТЛ). Ежегодно список общеобразовательных учреждений, которые становятся партнёрами университета и получают возможность участвовать в конкурсе, пополняется. В настоящее время стипендии учреждены для учащихся четырёх образовательных организаций Томска: ТФТЛ, лицея № 1 имени А. С. Пушкина, школы «Перспектива», Дворца творчества детей и молодёжи.
Победителями конкурсного отбора в первом полугодии 2021 года признаны 14 старшеклассников:
Конкурс на получение стипендии ректора ТУСУРа является открытым и проводится два раза в год по результатам полугодия. На первом этапе претендентов выбирают внутри каждого учебного заведения, после чего их рассматривает комиссия с участием представителей ТУСУРа. Претендовать на стипендию могут старшеклассники, которые учатся на хорошо и отлично по всем предметам, имеют призовые места в конкурсах и олимпиадах регионального, всероссийского и международного уровней по предметам естественнонаучного цикла и технического профиля и активно заняты в проектной, исследовательской деятельности.
Стипендия ректора ТУСУРа назначается на одно полугодие. Победители прошедшего конкурса будут получать ежемесячную стипендию в период с 1 февраля по 30 июня 2021 года.